优发国际登陆_优发国际登陆-欢迎您!!!


  公司电话: 010-6594 5597
 
首 页< 技术服务

真菌全国际重测序




真菌全国际重测序(Fungi Whole Genome Re-sequencing),是指对有参考国际的真菌个体或群体进行登陆量测序(待测菌株与参考国际的序列相似性 ≥ 98%),将测序数据比对至参考国际上,获得真菌个体或群体相对于参考国际的 SNPInDelCNV SV 等一系列变异信息。

产品参数



产 品

文库插入片段大小(bp)

测序平台及测序模式

测序深度

交付指标

项目周期

重测序A

300 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100 ×

数据量

35 个自然日

重测序B

300 ~ 500

Illumina HiSeq,PE150

~100 ×

数据量

40 个自然日


技术线路

真菌国际重测序技术路线.jpg

信息分析内容


序 号

分析项目

类 别

分 析

备 注

1

原始数据整理统计

A



2

数据质控

A



3

高质量数据获取

A



4

参考国际整理

A



5

序列比对分析

A



6

序列比对结果统计

A



7

SNP检测及注释

A



8

INDEL检测及注释

A



9

CNV分析

A



10

SV分析

A



11非同义SNP及InDel的可视化B

12基于群体SNP的进化树重构B
样 品 ≥ 3
13基于群体SNP的PCA分析B
样 品 ≥ 3
14国际序列拼接B
样 品 ≥ 3
15国际拼装效果评价B
样 品 ≥ 3
16全基因序列比对B
样 品 ≥ 3
17外源插入片段检测B
提供参考国际

A:标准信息分析内容B:高级信息分析内容。




分析结果展示



真菌国际重测序结果展示.jpg

 

登陆菌种鉴定分析登陆组分析登陆检测分析 动植物国际分析转录调控

   真菌全国际重测序

   细菌全基因重测序

   登陆新种鉴定分析

   登陆菌种多相鉴定分析

   酵母菌快速鉴定分析

   登陆序列分析

   菌群多样性组成谱全长测序

   菌群多样性组成谱测序

   宏国际测序分析

   宏转录组测序分析

   标记基因全长测序

   扩增子/功能基因测序

   第三代登陆量测序平台

   真菌国际de novo测序

   细菌全国际完成图测序

   真菌近完成图测序

   PCR-DGGE菌群分析

   环境中活菌群分析

   产品登陆娱乐

   产品污染菌分析

   动植物国际全长三代测序

   动植物国际de novo测序

   SSR分子标记开发

   全国际关联分析

   群体进化关系

   遗传图谱构建

   BSA性状定位

   全长转录组测序

   全转录组测序

   转录组测序

   Small RNA测序

   SSR/STR/微卫星DNA技术

   扩增片段长度多态性(AFLP)


公司电话:010-6594 5597/6591 9547 传 真:010-6591 9547 E-mail:biogenro88@126.com 挖土机租赁京ICP备08004776-2    京公网安备110105010393