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SSR分子标记开发




微卫星DNAMicrostatellite),又称简单重复序列(Simple Sequnce Repeat, SSR),指DNA国际中1-6个核苷酸的简单重复序列。在各种真核生物国际中广泛存在,多数以26个碱基为核心单位、串联重复排列的序列。



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遗传图谱构建 种质鉴定 遗传多样性分析 基因定位 数量性状基因座(QTL)分析



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测序平台及模式

Illumina MiSeq, PE250

样本选择及数据量

1-5 个样,推荐1.0 Gb;

5-10 个样,推荐1.5 Gb;

10-20 个样,推荐2.0 Gb;

备注:不同样本分别提取DNA后等量混合建库

DNA样本量

总量≥1.0 μg,浓度≥20 ng/μl

(总样本)

项目周期

标准分析36天

交付指标

提供不少于100对引物(经过筛选后具有多态性的)

参考国际

有参、无参均可


 

技术线路:

SSR分子标记开发技术路线.jpg

信息分析内容



序 号

分析项目

类 别

分 析

1

下机数据统计

A

2

数据质控

A

3

高质量数据获取

A

4

SSRs搜索结果及统计

A

5

SSRs模体结果及统计

A

6

SSRs聚类及结果统计

A

7

SSRs多态性评估

A

8

SSRs引物设计

A

A:标准信息分B:高级信息分C:个性化分析




分析结果展示



SSR分子标记开发分析结果.jpg


登陆菌种鉴定分析登陆组分析登陆检测分析 动植物国际分析转录调控

   真菌全国际重测序

   细菌全基因重测序

   登陆新种鉴定分析

   登陆菌种多相鉴定分析

   酵母菌快速鉴定分析

   登陆序列分析

   菌群多样性组成谱全长测序

   菌群多样性组成谱测序

   宏国际测序分析

   宏转录组测序分析

   标记基因全长测序

   扩增子/功能基因测序

   第三代登陆量测序平台

   真菌国际de novo测序

   细菌全国际完成图测序

   真菌近完成图测序

   PCR-DGGE菌群分析

   环境中活菌群分析

   产品登陆娱乐

   产品污染菌分析

   动植物国际全长三代测序

   动植物国际de novo测序

   SSR分子标记开发

   全国际关联分析

   群体进化关系

   遗传图谱构建

   BSA性状定位

   全长转录组测序

   全转录组测序

   转录组测序

   Small RNA测序

   SSR/STR/微卫星DNA技术

   扩增片段长度多态性(AFLP)


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